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RT-PCR虛擬實(shí)驗(yàn)-2

【總RNA提取】
  【出現(xiàn)工作臺界面】
  【左側(cè)】:電動勻漿機(jī)*、臺式離心機(jī)、盛有冰的容器(不帶蓋)、玻璃平皿**、微量取液器、盛有消毒槍頭的塑料盒、EP管、1ml勻漿瓶、無菌手術(shù)刀*、無菌手術(shù)鑷*、計(jì)時器
           *鼠標(biāo)箭頭放上:說明框顯示:“DEPC水處理過”,3秒鐘后消失;
**鼠標(biāo)箭頭放上:說明框顯示:“所有玻璃器皿先用酸處理,沖洗干凈,高壓消毒”,3秒鐘后消失)
   【右側(cè)】:待提取組織(肝臟)、DEPC水*、異丙醇、氯仿、75%冰乙醇
            (*鼠標(biāo)箭頭放上:一秒鐘后“實(shí)驗(yàn)注意”顯示:1%焦碳酸二乙酯:去除外源性RNA酶)
   【畫面中央】:工作臺:一塊象征性的平臺,有“工作臺”字樣
            (鼠標(biāo)箭頭放上:一秒鐘后“實(shí)驗(yàn)注意”顯示:DEPC水處理過)
   【畫面右下角】:垃圾桶(有骷髏頭圖形標(biāo)記)
   【界面按鈕設(shè)計(jì)】:實(shí)驗(yàn)注意:有內(nèi)容時自動顯示
                    實(shí)驗(yàn)提示:步箭頭放上自動顯示,以后每一步均自動顯示
                     重新操作:返回到上一步結(jié)束
退出實(shí)驗(yàn):回到本步驟界面
退出運(yùn)行:回到首頁
關(guān)閉音樂:實(shí)驗(yàn)開始,背景音樂自動響起。按此鍵,即關(guān)閉音樂
【操作開始】
1、工作臺中央的盛冰的容器---容器中放有和容器口齊平的碎冰。
   實(shí)驗(yàn)提示:按順序選擇玻璃平皿、肝臟組織、手術(shù)刀,切碎標(biāo)本。
 
2、切碎標(biāo)本 ------ 選擇玻璃平皿放置于盛冰容器中央,拖動肝臟組織放置于玻璃平皿中(鼠標(biāo)箭頭放置于肝臟上時,說明框顯示:0.1g小鼠肝臟,3秒鐘后隱去)。點(diǎn)擊無菌手術(shù)刀,拖動手術(shù)刀至肝臟組織上(該動作完成后,自動出現(xiàn)說明框:切碎肝臟組織,同時手術(shù)刀上下做切碎動作,三秒鐘后動作停止,手術(shù)刀回到原位)。
   實(shí)驗(yàn)提示:使用無菌鑷子,將肝臟組織放入1ml勻漿瓶內(nèi)。
 
3、移動1ml 勻漿瓶----點(diǎn)擊勻漿瓶,并拖動至工作臺中央的冰盒內(nèi);點(diǎn)擊無菌鑷子,鼠標(biāo)變?yōu)殍囎有螤?,將玻璃平皿上的切碎組織夾入勻漿瓶內(nèi)(該動作完成后,玻璃平皿及無菌鑷子回到工作臺界面原位)
     實(shí)驗(yàn)提示:點(diǎn)擊微量吸液器,點(diǎn)擊裝有槍頭的塑料盒,盒打開。微量吸液器裝上槍頭,拖動微量吸液器至Trizol處,吸取Trizol,加入EP管。
 
4、加入Trizol---- 1 點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取1ml液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“1ml槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上(槍頭為藍(lán)色);3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至Trizol處,點(diǎn)擊Trizol(槍頭內(nèi)顯示吸取1ml紅色液體);4拖動微量吸液器至勻漿瓶處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,微量吸液器回到吸液架上。
    實(shí)驗(yàn)提示:選擇勻漿機(jī);拖動勻漿瓶至勻漿機(jī);點(diǎn)擊勻漿機(jī),勻漿兩次,至勻漿瓶內(nèi)液體變?yōu)榫灰后w。
 
    5、勻漿----
①    動畫顯示逆時針擰松電機(jī)套下端連接螺紋(不用全部擰下),插入1ml勻漿杵子后順時針擰緊(如插入較緊時可邊插邊用手往上擰)。文本框顯示“擰松電機(jī)套下端連接螺紋(不用全部擰下),插入1ml勻漿杵子后擰緊(如插入較緊時可邊插邊用手往上擰)”
②    將1ml勻漿瓶夾在試管夾上,對好中心,握住手柄上下試動,至完全對直,再把瓶子夾緊(動畫顯示紅色手柄下拉,勻漿杵子伸入勻漿瓶內(nèi),瓶子夾緊后自動恢復(fù))
③    點(diǎn)擊冰盒,拖動到勻漿瓶底部,打開冰盒蓋,使勻漿瓶底部接觸冰。(文本框顯示“加冰浴防止溫度升高使組織失活”) 冰盒 開蓋后里面的冰
④    打開電源開關(guān),把調(diào)速調(diào)至最小,右手把握控制手柄,
運(yùn)動杵子至瓶口配合處,調(diào)節(jié)調(diào)速旋扭至所要的速度。即開始勻漿,控制手柄向下運(yùn)動至瓶底部(不能太用力),再往上運(yùn)動至與瓶配合處,往復(fù)運(yùn)動至成紅色均一液體。
       ⑤ 勻漿機(jī)回到原位置,勻漿瓶仍位于冰盒中,將勻漿瓶內(nèi)液體倒入1.5ml離心管內(nèi),離心管置于冰盒內(nèi),勻漿瓶自動消失。
 
文本框顯示:
“實(shí)驗(yàn)注意:1、電動玻璃勻漿機(jī)嚴(yán)禁在勻漿杵子未放入勻漿器內(nèi)時懸轉(zhuǎn),及無放入組織、液體等空瓶研磨。
2、      如使用中由于負(fù)載過大(往往運(yùn)動過快)發(fā)生卡住時,手柄應(yīng)速向上運(yùn)動但勻漿杵子不脫離液面。
3、      勻漿要徹底,如一次勻漿不徹底,需再進(jìn)行一次”
 
          實(shí)驗(yàn)提示:點(diǎn)擊EP管,拖出冰盒,點(diǎn)擊計(jì)時器,室溫下靜置5分鐘。
實(shí)驗(yàn)提示:靜置使細(xì)胞充分裂解,核蛋白中核酸與蛋白解離。
 
     6、靜置---- 1點(diǎn)擊EP管,拖動EP管至冰盒外,冰盒回到原位;2點(diǎn)擊計(jì)時器,拖動計(jì)時器至操作臺中央;3再次點(diǎn)擊計(jì)時器,開始計(jì)時(音樂出現(xiàn)倒計(jì)時聲音,說明框顯示“室溫靜置5分鐘”,持續(xù)時間3秒鐘后隱去),說明框隱去后倒計(jì)時聲音停止,計(jì)時器退回原位置,冰盒移動至操作臺中央,EP管自動至冰盒內(nèi)。
        實(shí)驗(yàn)提示: 點(diǎn)擊微量吸液器,加入槍頭,吸取0.2ml氯仿。
 
 7、加入氯仿----點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取0.2ml液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“0.2ml槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至氯仿處,點(diǎn)擊氯仿(槍頭內(nèi)顯示吸取0.2ml液體;實(shí)驗(yàn)注意:必需按總體積的1/5加入);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到吸液架上。
         實(shí)驗(yàn)注意:氯仿的作用:1、促進(jìn)有機(jī)相和水相的分離;2、去除上清中痕量的酚。
實(shí)驗(yàn)提示:劇烈振蕩
 
8、振蕩---- 1點(diǎn)擊EP管(說明框內(nèi)顯示:劇烈震蕩15s。EP管上下顛倒混勻振蕩,3秒鐘后停止,重新位于冰盒內(nèi))
     實(shí)驗(yàn)提示:靜置10分鐘
 
      9、靜置---- 1點(diǎn)擊計(jì)時器,拖動計(jì)時器至操作臺中央;3再次點(diǎn)擊計(jì)時器,開始計(jì)時(音樂出現(xiàn)倒計(jì)時聲音,說明框顯示“靜置10分鐘”,持續(xù)時間5秒鐘后隱去),說明框隱去后倒計(jì)時聲音停止,計(jì)時器退回原位置。
      實(shí)驗(yàn)提示:點(diǎn)擊離心機(jī),配平,開始離心
 
 10、離心---- 1點(diǎn)擊離心機(jī),拖動離心機(jī)至操作臺中央,離心機(jī)蓋子自動打開,其內(nèi)可見已放置一配平管(說明框顯示“配平管”,持續(xù)3秒鐘后隱去);2拖動EP管至配平管對面(其余孔不能放進(jìn),放置正確后,離心機(jī)蓋子自動關(guān)閉);3提示框出現(xiàn):“選擇溫度______℃”,“選擇轉(zhuǎn)速--______g”,“選擇時間______min”,實(shí)驗(yàn)提示分別顯示“4℃、12000g、15min”,若提示框內(nèi)填寫正確,提示框自動消失;若任何一項(xiàng)填寫錯誤,提示框持續(xù)存在;4點(diǎn)擊離心機(jī),開始離心,畫面停頓5秒鐘后,離心機(jī)蓋子自動打開(說明框顯示“離心結(jié)束”),EP管自動出現(xiàn)在操作臺中央(EP管內(nèi)液體分為3層:上層無色透明液體,約0.5ml,鼠標(biāo)置于該液體層,說明框內(nèi)顯示:“水相”,約3秒鐘后說明框隱去;中間白色不透明液體,約0.1ml,鼠標(biāo)置于該液體層,說明框內(nèi)顯示:“蛋白變性層”,約3秒鐘后說明框隱去;下層為紅色不透明液體,約0.6ml,鼠標(biāo)置于該液體層,說明框內(nèi)顯示:“有機(jī)相”,約3秒鐘后說明框隱去;),離心機(jī)蓋子蓋上,回到原位。
    實(shí)驗(yàn)提示:選擇新的EP管,點(diǎn)擊微量吸液器,裝好槍頭,轉(zhuǎn)移水相液體至新的EP管內(nèi)。
 
11、轉(zhuǎn)移---- 1點(diǎn)擊操作臺左側(cè)另外一只新EP管,并拖動至操作臺中央,EP管蓋子自動打開;2點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取水相液體”,3秒鐘后隱去);3點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“0.5ml槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;拖動微量吸液器至原EP管旁,原EP管蓋子自動打開;4微量吸液器伸入原EP管水相液體底層(實(shí)驗(yàn)注意提示:“不要碰到蛋白變性層”,),點(diǎn)擊微量吸液器吸取0.5ml液體,拖動微量吸液器至新EP管內(nèi),再次點(diǎn)擊微量吸液器,槍頭內(nèi)液體注入新EP管內(nèi);5重復(fù)步驟4。6原EP管蓋子自動蓋上,自動轉(zhuǎn)移至垃圾桶內(nèi);微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置;新EP管位于操作臺中央。
     實(shí)驗(yàn)提示:用微量吸液器加入等體積異丙醇。
 
12、加入異丙醇-----1點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取0.5ml液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“0.5ml槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至異丙醇處,點(diǎn)擊異丙醇(槍頭內(nèi)顯示吸取0.5ml無色透明液體;實(shí)驗(yàn)注意:加入等體積異丙醇);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置。
        實(shí)驗(yàn)注意:異丙醇的作用:沉淀RNA
實(shí)驗(yàn)提示:溫和顛倒混勻
 
13、混勻---- 1點(diǎn)擊EP管(說明框內(nèi)顯示:溫和顛倒混勻。3秒鐘后停止)
     實(shí)驗(yàn)提示:室溫靜置10分鐘
 
14、靜置---- 1點(diǎn)擊計(jì)時器,拖動計(jì)時器至操作臺中央;3再次點(diǎn)擊計(jì)時器,開始計(jì)時(音樂出現(xiàn)倒計(jì)時聲音,說明框顯示“室溫靜置10分鐘”,持續(xù)時間5秒鐘后隱去),說明框隱去后倒計(jì)時聲音停止,計(jì)時器退回原位置, EP管位于操作臺中央。
    實(shí)驗(yàn)提示:離心10分鐘
 
15、離心---- 1點(diǎn)擊離心機(jī),拖動離心機(jī)至操作臺中央,離心機(jī)蓋子自動打開,其內(nèi)可見已放置一配平管(說明框顯示“配平管”,持續(xù)3秒鐘后隱去);2拖動EP管至配平管對面(其余孔不能放進(jìn),放置正確后,離心機(jī)蓋子自動關(guān)閉);3提示框出現(xiàn):“選擇溫度______℃”,“選擇轉(zhuǎn)速--______g”,“選擇時間______min”,實(shí)驗(yàn)提示分別顯示“4℃、12000g、10min”,若提示框內(nèi)填寫正確,提示框自動消失;若任何一項(xiàng)填寫錯誤,提示框持續(xù)存在;4點(diǎn)擊離心機(jī),開始離心,畫面停頓3秒鐘后,離心機(jī)蓋子自動打開(說明框顯示“離心結(jié)束”),EP管自動出現(xiàn)在操作臺中央(EP管內(nèi)液體為無色透明液體,EP管底部可見一小塊白色固體物質(zhì)),離心機(jī)蓋子蓋上,回到原位。
     實(shí)驗(yàn)提示:棄去上清
 
16、棄上清----- 1 點(diǎn)擊EP管,EP管蓋子打開,同時鼠標(biāo)變?yōu)榇饕淮涡允痔椎氖值男螤睿?手抓住EP管,EP管自動緩慢傾斜,將其內(nèi)液體倒入垃圾桶內(nèi)(音樂出現(xiàn)倒水的聲音,過程持續(xù)3秒鐘);3EP管復(fù)位,內(nèi)無液體,底部仍可見白色固體物質(zhì),EP管蓋子保持打開。
     實(shí)驗(yàn)提示:加入1ml冰乙醇
 
17、加入冰乙醇 ---- 1點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取1ml液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“1ml槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至冰乙醇處,點(diǎn)擊異丙醇(槍頭內(nèi)顯示吸取1ml無色透明液體;說明框顯示:乙醇已預(yù)冷);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到吸液器架上。
       實(shí)驗(yàn)注意:冰乙醇的作用:脫水、除鹽。
       實(shí)驗(yàn)提示:離心
 
18、離心---- 1點(diǎn)擊離心機(jī),拖動離心機(jī)至操作臺中央,離心機(jī)蓋子自動打開,其內(nèi)可見已放置一配平管(說明框顯示“配平管”,持續(xù)3秒鐘后隱去);2拖動EP管至配平管對面(其余孔不能放進(jìn),放置正確后,離心機(jī)蓋子自動關(guān)閉);3提示框出現(xiàn):“選擇溫度______℃”,“選擇轉(zhuǎn)速--______g”,“選擇時間______min”,實(shí)驗(yàn)提示分別顯示“4℃、7500g、5min”,若提示框內(nèi)填寫正確,提示框自動消失;若任何一項(xiàng)填寫錯誤,提示框持續(xù)存在;4點(diǎn)擊離心機(jī),開始離心,畫面停頓3秒鐘后,離心機(jī)蓋子自動打開(說明框顯示“離心結(jié)束”),EP管自動出現(xiàn)在操作臺中央(EP管內(nèi)液體為無色透明液體,EP管底部可見一小塊白色固體物質(zhì)),離心機(jī)蓋子蓋上,回到原位。
        實(shí)驗(yàn)提示:棄上清
 
19、棄上清--- 同步驟16
        實(shí)驗(yàn)提示:空氣干燥5-10分鐘
 
20、空氣干燥---- 1 畫面停頓5s鐘,說明框顯示“空氣干燥10min”。
       實(shí)驗(yàn)注意:空氣干燥的作用,使乙醇揮發(fā)。
       實(shí)驗(yàn)提示:加入DEPC水,溶解。
 
21、加入DEPC水---- 1點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取50ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“0.1ml槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至DEPC水處,點(diǎn)擊(槍頭內(nèi)顯示吸取無色透明液體;說明框顯示:1%DEPC水);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,EP管底部白色物質(zhì)逐漸消失,變?yōu)闊o色透明液體;微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置。
       實(shí)驗(yàn)注意:怎么還不溶?55-60℃水浴可助溶,但時間需控制在10分鐘以內(nèi)。
            實(shí)驗(yàn)注意:提取的總RNA置于4℃或冰浴中,立即用于下游實(shí)驗(yàn),或立即置于-80℃冰箱保存。但無論采用何種方法提取和保存的RNA,都往往會被很快降解,因而建議避免提取RNA后保存。
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
【對提取的總RNA進(jìn)行分析】
【出現(xiàn)工作臺界面】
【左側(cè)】:電泳槽、電泳儀、紫外燈、電子天平(內(nèi)有稱量紙一張)、微波爐、小藥勺、微量取液器、盛有消毒槍頭的塑料盒、置冰盒中EP管(2只,其中一只內(nèi)含有少量無色透明液體,鼠標(biāo)箭頭放上,說明框顯示:“已提取的總RNA”)、塑料薄膜、三角燒瓶、50ml量筒
   【右側(cè)】:瓊脂糖(白色粉末)、加樣緩沖液(藍(lán)色)、溴乙錠*(桔紅色)
            實(shí)驗(yàn)注意:溴乙錠【Ethidium Bromide,EB】:是一種高度靈敏的熒光染色劑,用于觀察瓊脂糖和聚丙烯酰胺凝膠中的DNA。EB是強(qiáng)的變性劑,具有致癌性,操作時必須戴手套?。?! 由于EP具有毒性,實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,應(yīng)對含有EB的溶液進(jìn)行凈化處理?。。。。∧阒朗裁唇袃艋幚韱?
   【畫面中央】:工作臺:一塊象征性的平臺,有“工作臺”字樣
   【畫面右下角】:垃圾桶(有骷髏頭圖形標(biāo)記)
   【界面按鈕設(shè)計(jì)】:實(shí)驗(yàn)注意:有內(nèi)容時自動顯示
                    實(shí)驗(yàn)提示:步箭頭放上自動顯示,以后每一步均自動顯示
                    重新操作:返回到上一步結(jié)束
退出實(shí)驗(yàn):回到本步驟界面
退出運(yùn)行:回到首頁
關(guān)閉音樂:實(shí)驗(yàn)開始,背景音樂自動響起。按此鍵,即關(guān)閉音樂
【操作開始】
      實(shí)驗(yàn)提示:點(diǎn)擊電子天平,點(diǎn)擊藥勺,稱取瓊脂糖0.25g。
1、   稱取瓊脂糖 ----- 1點(diǎn)擊電子天平,拖動至操作臺中央,電子天平拉門自動打開,可見托盤上已有濾紙一張;2點(diǎn)擊藥勺,并拖動至瓊脂糖處;3點(diǎn)擊藥勺(動畫演示藥勺挖取瓊脂糖若干),并拖動至電子天平內(nèi)(動畫演示藥勺傾斜,瓊脂糖落入天平內(nèi)稱量紙上),藥勺回原位,電子天平門關(guān)上,說明框顯示:“0.3g瓊脂糖”,3秒鐘后濾紙連同瓊脂糖自動位于操作臺桌面上,電子天平回到原位。
           實(shí)驗(yàn)提示:點(diǎn)擊量筒,量取1×TAE電泳緩沖液25ml。
 
2、   量取電泳緩沖液----- 1點(diǎn)擊量筒,拖動至操作臺中央;2點(diǎn)擊裝有電泳緩沖液的試劑瓶,試劑瓶蓋子自動打開,鼠標(biāo)變?yōu)槭值男螤睿苿印笆帧?,抓住試劑瓶,將其?nèi)的液體傾倒入量筒內(nèi)(音樂出現(xiàn)倒水的聲音,說明框顯示“量取25ml液體”,3秒鐘后試劑瓶回到原位,蓋子蓋上,量筒內(nèi)顯示25ml液體,鼠標(biāo)變?yōu)檎P螤睿?/div>
           實(shí)驗(yàn)提示:點(diǎn)擊三角燒瓶,將瓊脂糖及量好的電泳緩沖液倒入燒瓶內(nèi),并使用微量吸液器,加入1.25ulEB(溴乙錠),于微波爐內(nèi)加熱,溶解瓊脂糖。
 
3、   溶解瓊脂糖----- 1點(diǎn)擊三角燒瓶,并拖動至操作臺中央;2點(diǎn)擊放有瓊脂糖的濾紙,鼠標(biāo)變?yōu)槭值男螤睿プ…傊菫V紙,將瓊脂糖倒入三角燒瓶內(nèi);3“手”抓住量筒,將量筒內(nèi)液體倒入三角燒瓶(音樂出現(xiàn)倒水的聲音),3秒鐘后液體倒完,鼠標(biāo)變回原來的形狀,量筒回到原位置,濾紙回到垃圾桶內(nèi);4點(diǎn)擊微波爐,并拖動至桌面中央,微波爐蓋子打開; 5點(diǎn)擊三角燒瓶,鼠標(biāo)變?yōu)槭值哪樱プ∪菬?,移動至微波爐內(nèi),三角燒瓶口自動出現(xiàn)一蓋子,微波爐蓋子關(guān)閉; 6點(diǎn)擊微波爐,說明框顯示“溶解瓊脂糖”,瓊脂糖顆粒逐漸溶解,變?yōu)闊o色透明液體,持續(xù)約30秒鐘,微波爐蓋子打開。實(shí)驗(yàn)注意:小心!不要使瓊脂糖滿溢至燒瓶外! 7點(diǎn)擊微波爐內(nèi)的三角燒瓶,鼠標(biāo)變?yōu)橐恢话咨ぷ魇痔谞?,自動拿起三角燒瓶,放置于操作臺桌面上,畫面停頓3秒鐘(說明框顯示:冷卻至大約60℃,不要冷卻時間過長,避免瓊脂糖凝固);8點(diǎn)擊微量吸液器,并拖動至操作臺中央,點(diǎn)擊微量吸液器槍頭,槍頭裝至微量吸液器上;拖動微量吸液器至溴已錠處,說明框顯示“有毒,小心操作,并出現(xiàn)一骷髏頭畫面”,3秒鐘后消失;9點(diǎn)擊微量吸液器,動畫顯示淡紅色液體吸入槍頭的畫面,說明框顯示“吸取1.25ul溴已錠”,3秒鐘后消失;10拖動微量移液器至三角燒瓶內(nèi),燒瓶蓋子自動至垃圾桶,畫面顯示液體注入到瓶內(nèi)的畫面,槍頭自動到垃圾桶,微量吸液器回到移液架。
        實(shí)驗(yàn)提示:將加樣梳放置于膠板上,將溶解后的瓊脂糖倒入膠板內(nèi),待瓊脂糖凝膠凝固后拔出點(diǎn)樣梳。
        實(shí)驗(yàn)注意:凝膠顆粒必須完全溶解【圖示瓊脂糖完全溶解和部分溶解對實(shí)驗(yàn)結(jié)果影響的圖】
 
4、   澆板----- 1點(diǎn)擊膠板,并拖動至操作臺中央;2點(diǎn)擊點(diǎn)樣梳,點(diǎn)樣梳自動架至膠板一端,說明框顯示“齒梳的底部離膠板平面的距離為0.5-1mm”;3點(diǎn)擊三角燒瓶,鼠標(biāo)變?yōu)榇魇痔资值男螤?,抓住三角瓶,三角燒瓶緩慢傾倒,液體注入膠板內(nèi),膠板內(nèi)液體逐漸增加(畫面要有液體為稍粘稠的感覺),說明框內(nèi)顯示“注意避免氣泡”,3秒鐘后說明框隱去,液體倒完,鼠標(biāo)變?yōu)樵螤?,三角燒瓶回到原位置?膠板內(nèi)的瓊脂糖膠在室溫逐漸凝固成半透明的乳白色的固體(約3秒鐘),點(diǎn)擊點(diǎn)樣梳,點(diǎn)樣梳回到原位,畫面顯示膠板內(nèi)的瓊脂糖為乳白色半透明的固體,一端可見點(diǎn)樣孔。
            實(shí)驗(yàn)提示:點(diǎn)擊并拖動電泳槽至操作臺中央,將膠板小心放入電泳槽內(nèi)。
 
5、   準(zhǔn)備電泳槽 ----- 1點(diǎn)擊電泳槽,并拖動電泳槽至操作臺中央,其內(nèi)可見無色透明液體(說明框顯示:1*TAE電泳緩沖液);2 點(diǎn)擊膠板,鼠標(biāo)變?yōu)槭值男螤?,把膠板將其放入電泳槽內(nèi)(實(shí)驗(yàn)注意顯示:點(diǎn)樣孔一端置電泳槽的陰極)。   
實(shí)驗(yàn)提示:使用微量吸液器,吸取5ul總RNA,點(diǎn)于塑料薄膜上.
 
6、吸取樣品 ---- 1點(diǎn)擊含有RNA的EP管,并拖動至操作臺中央,EP管蓋子打開;2點(diǎn)擊塑料薄膜,拖動至操作臺中央;3點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取5ul總RNA液體”,3秒鐘后隱去);4點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“10ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;5拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)EP管內(nèi)含有總RNA的液體吸入槍頭內(nèi)的畫面);6拖動微量吸液器至塑料薄膜處,點(diǎn)擊微量吸液器,吸液器內(nèi)液體滴入到塑料薄膜上(液體為一個小水滴狀);7EP管蓋子自動蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到移液架上。
實(shí)驗(yàn)提示:使用微量吸液器吸取6×上樣緩沖液(Loading buffer)1ul,滴入塑料薄膜上的總RNA液滴中,反復(fù)吸取幾次,混勻,避免氣泡出。
 
7、吸取上樣緩沖液---- 1點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取1ul液體”,3秒鐘后隱去);2點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“10ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3拖動微量吸液器至上樣緩沖液處(藍(lán)色),點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)EP管內(nèi)液體吸入槍頭內(nèi)的畫面);4拖動微量吸液器至塑料薄膜處,點(diǎn)擊微量吸液器,吸液器內(nèi)液體被打到塑料薄膜上的總RNA的液滴內(nèi)(液體為一個小水滴狀),反復(fù)吸取液體幾次,混勻,液體變?yōu)榫鶆虻{(lán)色;5微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置。
      實(shí)驗(yàn)提示:點(diǎn)擊電泳槽,將塑料薄膜上的液體加入到電泳槽上的凹槽內(nèi)。
 
8、上樣 ---- 1點(diǎn)擊電泳槽,并拖動至操作臺中央(電泳槽內(nèi)靠近陰極側(cè)可見一排點(diǎn)樣孔);2點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“10ul槍頭”,3秒鐘后隱去),槍頭加入到微量吸液器上;3拖動微量吸液器至塑料薄膜處,點(diǎn)擊塑料薄膜上的液體(出現(xiàn)塑料薄膜上液體吸入槍頭的畫面);4拖動微量吸液器至凝膠板上的點(diǎn)樣孔處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)液體注入凝膠孔內(nèi)的畫面,液體為淡藍(lán)色的液體)。
        實(shí)驗(yàn)提示:點(diǎn)擊電泳儀,連接正負(fù)極,開始電泳。
 
9、電泳 ----- 1點(diǎn)擊電泳儀,電泳儀移動至操作臺中央;2點(diǎn)擊電泳槽上的“陰極”顯示扭,鏈接到電泳儀的“陰極”(出現(xiàn)黑色導(dǎo)線鏈接兩端的畫面),點(diǎn)擊電泳槽“陽極”顯示扭,鏈接到電泳儀的“陽極”(出現(xiàn)紅色導(dǎo)線鏈接兩端的畫面);2持續(xù)點(diǎn)擊電泳儀上“電壓選擇”按鈕,電泳儀顯示屏上電壓從“50V”快速升高到“100v”;持續(xù)點(diǎn)擊電泳儀上“時間選擇”按鈕,電泳儀顯示屏上時間從“10min”快速升高到“30min”;點(diǎn)擊電泳儀上“開始”按鈕,說明框顯示“開始電泳”,畫面顯示電泳儀陰極不斷出現(xiàn)很多微小氣泡,藍(lán)色液體逐漸向陽極移動(畫面持續(xù)5秒鐘);3說明框顯示“30分鐘后”,藍(lán)色液體移動至瓊脂糖凝膠的中間。
        實(shí)驗(yàn)提示:點(diǎn)擊紫外分析儀,觀察結(jié)果。
 
10、觀察結(jié)果---- 1點(diǎn)擊紫外分析儀,紫外分析儀自動移動至操作臺中央;2點(diǎn)擊電泳槽,拖動瓊脂糖凝膠至紫外分析儀中的平板上。電泳儀、電泳槽回到原位;3點(diǎn)擊紫外分析儀,觀察結(jié)果,畫面顯示“三條帶”,說明框顯示“28s ,18s,5sRNA”。
實(shí)驗(yàn)提示:準(zhǔn)備分光光度計(jì)分析RNA純度,點(diǎn)擊EP管,稀釋RNA。
 
    11、準(zhǔn)備EP管----點(diǎn)擊新的EP管,并拖動至工作臺中央的冰盒內(nèi)(EP管外顯示刻度0.5ml,1.0ml,鼠標(biāo)置于EP管上,說明框內(nèi)顯示“1.5mlEP管”,3秒鐘后隱去)。
實(shí)驗(yàn)提示:加入DEPC水98ul
 
12、加入DEPC水98ul---- 1 點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取98ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“100ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動DEPC水處,點(diǎn)擊DEPC水(槍頭內(nèi)顯示吸取98ul白色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
實(shí)驗(yàn)提示:加入RNA2ul
 
    13、加入RNA2ul ---- 1 點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取2ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“10ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動RNA處,點(diǎn)擊RNA水(槍頭內(nèi)顯示吸取2ul白色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
 實(shí)驗(yàn)提示:將稀釋的RNA加入比色皿中
 
     14、將稀釋的RNA加入比色皿中----①點(diǎn)擊比色皿,并拖動至工作臺中央的冰盒內(nèi),② 點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取100ul液體”,3秒鐘后隱去);③ 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“100ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;④點(diǎn)擊微量吸液器,拖動稀釋的RNA處,點(diǎn)擊稀釋的RNA水處(槍頭內(nèi)顯示吸取100ul白色液體);⑤拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
實(shí)驗(yàn)提示:點(diǎn)擊分光光度計(jì),分析RNA純度
 
15、點(diǎn)擊分光光度計(jì),分析RNA純度----1點(diǎn)擊分光光度計(jì),拖動分光光度計(jì)自動移動至操作臺中央,分光光度計(jì)蓋子自動打開;2將比色皿加入分光度計(jì)內(nèi),分光光度計(jì)蓋子自動合上;3點(diǎn)擊“開始分析”,觀察結(jié)果,畫面顯示A260/A280=2.0”。
 
實(shí)驗(yàn)注意:通過電泳的結(jié)果觀察分析提取的總RNA有無降解:完整的RNA的電泳可明顯觀察到28s和18s兩條帶,并且28s大約是18s的兩倍寬。若兩條帶不明顯,則說明RNA部分降解。
RNA的純度確定:A260/A280≈2.0,如果A260/A230<2,除鹽不充分。
計(jì)算RNA的濃度:RNA原液的濃度=(A260-A230)*稀釋倍數(shù)*40(ng/ul)
 
【逆轉(zhuǎn)錄】
  【出現(xiàn)工作臺界面】
  【左側(cè)】:PCR儀、盛有冰的容器(不帶蓋)、微量取液器、盛有消毒槍頭的塑料盒、EP管
   【右側(cè)】:總RNA、MgCl2(25mM)(無色液體,水滴狀表示)、Reverse transcription 10*Buffer(白色透明波浪狀液體)、dNTP Mixture(10mM)(A、T、G、C)、RNase Inhibitor(白色球狀液體)、Random 9 mers(單鏈RNA狀)、Reverse Transcriptase(   狀)、DEPC水(水滴狀)
   【畫面中央】:工作臺:一塊象征性的平臺,有“工作臺”字樣
   【界面按鈕設(shè)計(jì)】:實(shí)驗(yàn)注意:有內(nèi)容時自動顯示
                    實(shí)驗(yàn)提示:步箭頭放上自動顯示,以后每一步均自動顯示
                    重新操作:返回到上一步結(jié)束
退出實(shí)驗(yàn):回到本步驟界面
退出運(yùn)行:回到首頁
關(guān)閉音樂:實(shí)驗(yàn)開始,背景音樂自動響起。按此鍵,即關(guān)閉音樂
【操作開始】
       實(shí)驗(yàn)提示:將2ul總RNA加入EP管,點(diǎn)擊PCR儀,70℃孵育10分鐘。
1、 孵育 ---- 1點(diǎn)擊EP管, EP管蓋子自動打開,EP管自動移動至桌面中央;2點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取2ul液體”,3秒鐘后隱去);3點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“10ul槍頭”,3秒鐘后隱去),槍頭自動加入到微量吸液器上(槍頭為黃色);4點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至總RNA處,點(diǎn)擊總RNA(槍頭內(nèi)顯示吸取2ul無色透明液體);5拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到移液架上,槍頭自動至垃圾桶內(nèi);6點(diǎn)擊PCR儀,并拖動至操作臺中央,PCR儀蓋子自動打開;7拖動EP管放入PCR儀內(nèi),PCR儀蓋子自動蓋上(說明框顯示:孵育:______℃,時間:-_______分鐘;實(shí)驗(yàn)提示:孵育70℃,10分鐘,若填錯,實(shí)驗(yàn)不能繼續(xù));8說明框顯示:“10分鐘后”,3秒鐘后隱去,PCR儀蓋子自動打開,EP管位于桌面上的冰盒內(nèi),PCR儀蓋子關(guān)上,PCR儀回到原位。
         實(shí)驗(yàn)注意:去除RNA二級結(jié)構(gòu)。
      實(shí)驗(yàn)提示:將EP管立即拖動至盛有冰的容器內(nèi)。
 
2、配制反應(yīng)液----- 1點(diǎn)擊MgCl2(25mM),說明框顯示:加入______ul,實(shí)驗(yàn)提示:4ul,若填錯,實(shí)驗(yàn)不能繼續(xù);填寫正確后,MgCl2(25mM)自動加入EP管內(nèi),EP管內(nèi)液面上升;2點(diǎn)擊Reverse transcription 10*Buffer,說明框顯示:加入______ul,實(shí)驗(yàn)提示:2ul,若填錯,實(shí)驗(yàn)不能繼續(xù);填寫正確后Reverse transcription 10*Buffer自動加入EP管內(nèi),EP管內(nèi)液面上升;3同上依次加入dNTP Mixture(10mM) 2ul、RNase Inhibitor 0.5ul、Random 9 mers 1ul、Reverse Transcriptase 1ul、DEPC水 7.5ul;4加入完成后,EP管蓋子自動蓋上,自動混勻。
實(shí)驗(yàn)注意:以上液體加入不分先后順序,均需使用微量吸液器。
       實(shí)驗(yàn)提示:點(diǎn)擊PCR儀,進(jìn)行cDNA反應(yīng)。
 
3、逆轉(zhuǎn)錄----- 1點(diǎn)擊PCR儀, PCR儀自動移動至操作臺中央,蓋子自動打開;2拖動EP管放入PCR儀內(nèi),PCR儀蓋子自動蓋上,冰盒回到原位(說明框顯示:30℃,_______分鐘;42℃,_______分鐘;95℃,_______分鐘;5℃,_______分鐘。實(shí)驗(yàn)提示顯示:10分鐘,15分鐘,5分鐘,5分鐘)。3填寫完畢后,說明框提示:開始運(yùn)行,5秒鐘后隱去,PCR儀蓋子打開,EP管位于操作臺中央,PCR儀回到原位。
         實(shí)驗(yàn)提示:cDNA制備完成。
         各種溫度設(shè)置的作用
 
 
 
 
 
 
 
 
【RT-PCR擴(kuò)增hTNF-α基因】
  【出現(xiàn)工作臺界面】
  【左側(cè)】:PCR儀、振蕩器、微量取液器、盛有消毒槍頭的塑料盒、EP管
   【右側(cè)】:cDNA模板(DNA雙鏈結(jié)構(gòu)樣表示)、MgCl2(25mM) (無色液體,水滴狀表示)、10*Buffer(白色透明波浪狀液體)、dNTP Mixture(10mM)(AGTC)、Taq酶(   樣,鼠標(biāo)放上實(shí)驗(yàn)注意:-20℃保存,切勿反復(fù)凍融)、Forward引物(白色透明水滴狀液體)、Reverse 引物(白色透明水滴狀液體)、DEPC水(無色水滴狀液體)
   【畫面中央】:工作臺:一塊象征性的平臺,有“工作臺”字樣
   【畫面右下角】:垃圾桶(有骷髏頭圖形標(biāo)記)
   【界面按鈕設(shè)計(jì)】:實(shí)驗(yàn)注意:有內(nèi)容時自動顯示
                    實(shí)驗(yàn)提示:步箭頭放上自動顯示,以后每一步均自動顯示
                    重新操作:返回到上一步結(jié)束
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