分子也能剪？能！就有這么一把“剪刀”——新芝超聲波DNA打斷儀

作者：新芝生物　發(fā)布日期：2022-09-24

隨著下一代測序（Next-generation sequencing，NGS）技術(shù)的發(fā)展與成熟，在科研、診斷、體檢各市場領(lǐng)域的應(yīng)用范圍不斷擴大。如今，隨著市場不斷發(fā)展，測序技術(shù)自身開發(fā)速度卻逐漸放緩，樣品制備在NGS中的瓶頸效應(yīng)越來越明顯，以縮短時間、提高通量為主要目標(biāo)的新試劑、新儀器不斷涌現(xiàn)。同時，聚焦于樣本的更小處理體積的新方法也在不斷開發(fā)，但在NGS文庫構(gòu)建的過程中，DNA片段化始終是一個無法避開的步驟。

▲NGS高通量測序基本流程

Basicprocess for high-throughput sequencing NGS

對長鏈DNA（通常指生物染色體DNA）片段化的主要原因是短鏈DNA片段有利于進行DNA分子快速雜交和高靈敏目標(biāo)檢測，可顯著提升測序效率。目前，常用的染色體脫氧核糖核酸（Deoxyribonucleic acid， DNA）分子片段化方法主要有四種，分別為：DNA限制性酶切法、水動力剪切法、超聲波斷裂法、噴射霧化法，四種方法各有利弊。

▲DNA分子結(jié)構(gòu)形態(tài)

Molecularstructure and morphology of DNA

超聲打斷基于水動力剪切法和超聲波斷裂法，是最常見的DNA片段化方式。其原理為：液體在高頻率的脈沖作用下，產(chǎn)生無數(shù)的高壓點和低壓點，伴隨產(chǎn)生的空化泡存在幾毫秒又因壓力變化而爆破，在這個過程中液體內(nèi)形成瞬時高強度剪切力，這種作用力可以破碎細胞、影響蛋白質(zhì)和剪切DNA。在此特別推薦新芝生物的一款特色產(chǎn)品：SCIENTZ18-A超聲波DNA打斷儀，采用非接觸式的工作方式，單次最高處理量可達12個樣品，是染色質(zhì)免疫共沉淀（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）和DNA剪切研究平臺的標(biāo)準(zhǔn)化工具。